Bandes dessinées
- Manifeste Incertain tome 8 : Cartographie du souvenir (Noir sur Blanc, 2019)
- Manifeste Incertain tome 7 (Noir sur Blanc, 2018)
- Manifeste Incertain tome 6 (Noir sur Blanc, 2017)
- Manifeste Incertain tome 5 : Vincent Van Gogh, une biographie (Noir sur Blanc, 2016)
- Manifeste Incertain tome 4 (Noir sur Blanc, 2015)
- Manifeste Incertain tome 3 (Noir sur Blanc, 2014)
- Manifeste Incertain tome 2 (Noir sur Blanc, 2013)
- Alberto Giacometti sort de l’ombre, collectif (Buchet Chastel, Cahier Dessiné, 2013)
- Manifeste Incertain tome 1 (Noir sur Blanc, 2012)
- L’immense solitude : avec Friedrich Nietzsche et Cesare Pavese, orphelins sous le ciel de Turin (Noir sur Blanc, 2011
- En souvenir du monde, illustrations de Lea Lund, (Noir sur Blanc, 2010)
- Schopenhauer dans tous ses états, une anthologie inédite, dessins originaux et postface de Frédéric Pajak, (Gallimard, coll. « L’Arbalète », 2009)
- L’Étrange Beauté du monde dessins de Léa Lund, (Noir sur Blanc, 2008)
- Contre tous, portraits, (Gallimard, 2007)
- J’entends des voix, (Gallimard, coll. « L’Arbalète », 2006)
- Mélancolie, (Presses universitaires de France, 2004)
- Humour : une biographie de James Joyce écrite avec Yves Tenret (Presses universitaires de France, 2001)
- Nietzsche et son père (Presses universitaires de France, 2001)
- Première Partie : Les Poissons sont tragiques ; Fredi le Prophète ; Martin Luther, l’inventeur de la solitude (Presses universitaires de France, 2001)
- Nervosité générale, chansons & poèmes Presses universitaires de France, 2001)
- Le Chagrin d’amour, (Presses universitaires de France, 2000)
- Martin Luther, l’inventeur de la solitude, préface de Michel Thévoz, (éditions de l’Aire, 1997)
- Le Bon Larron, (Bernard Campiche éditeur, 1987)
- Manifeste incertain, Tome 1 (2012) Tome 2 (2013) Tome 3 (2014) Tome 4 (2015) Tome 5 (2016) Tome 6 (2017) Tome 7 (2018) (Noir sur Blanc)
Roman
- La Guerre sexuelle, (Gallimard, 2006)
